D’ici 2015, les premières installations de production de biocarburants de deuxième génération devraient être mises en place. L’UE a bloqué à 5 % le taux d’incorporation des agrocarburants dans les carburants fossiles d’où la nécessité de trouver une alternative n’entrant pas en concurrence avec les productions alimentaires. C’est le cas des biocarburants de deuxième génération, ceux-ci sont obtenus à partir de biomasse lignocellulosique ; paille, résidus forestiers, etc. D’après les estimations du Centre d’analyses stratégiques, la valorisation de 10 % des déchets agricoles et forestiers permettrait de couvrir 4 à 6 % des besoins en carburant pour les transports.
Mis à part les biocarburants, l’agriculture devrait aussi aider au développement d’autres énergies renouvelables, comme la méthanisation ou le photovoltaïque. On espère ainsi atteindre 20 % de production d’énergies renouvelables d’ici à 2020.